2026년 하반기 중소기업기술혁신개발사업 유망기술개발(구조혁신R&D) 시행계획 공고

중소벤처기업부 공고 제2026–253호

년도 중소기업기술혁신개발사업

2026

유망기술개발(구조혁신R&D) 하반기 시행계획 공고

년도 중소기업기술혁신개발사업 유망기술개발 (구조혁신 R&D)

2026

하반기 시행계획을 다음과 같이 공고하오니, 동 사업에 참여하고자 하는

중소기업은 사업 안내에 따라 신청하시기 바랍니다.

2026년 4월 9일

중소벤처기업부 장관

– 유의 사항 -

1.`사업전환계획 승인 기업` 중 구조혁신R&D 지원대상으로 중소벤처기업진흥공단이

추천한 기업만 제출이 가능합니다.

2.내역사업별 신청·접수 시기가 아래와 같이 상이하오니 반드시 확인하여

주시기 바랍니다.

구분 내역사업 세부과제 차수 공고 신청·접수 │ 선정평가 협약

중소기업 구조혁신 1차 │ 4월 23일 ~ 5월 11일 5월~6월 7월

하반기 │ 4월 9일

유망기술개발 R&D 2차 │ 6월 22일 ~ 7월 6일 8월 9월

지원과제 일정은 변동될 수 있으며, 세부 내용은 세부 과제별 공고 참조

3.신청자격 서류, 가점 증빙 서류 등 신청 서류 일체는 추가(수정)제출이

불가하오니, 내역사업별 신청 서류를 반드시 확인하여 주시기 바랍니다.

4.신청마감일 마감 시간(18시) 내 신청·접수를 완료하지 못한 경우 제출이

불가하며 전문기관 평가대상에서 제외 처리되므로 유의하여 주시기 바랍니다.

1.사업 소개

동 사업은 중소기업의 글로벌 시장확대와 기술경쟁력 강화를 위해

전략기술개발 및 글로벌 기술협력을 통한 R&D지원으로 중소기업의

혁신성장을 촉진되도록 지원하는 사업입니다.

– 1 -

2.주요 변경 또는 개선 사항

주요 변경‧개선 사항

구 분

‘25년도 │ ‘26년도

내역사업 │ 내내역사업

내역사업 │ 내내역사업

해외진출 │ 수출지향형 (2년, 10억원)

글로벌선도

수출지향형 경쟁형

기술개발

(4년, 20억원) 전략형 │ 글로벌협력형 (5년, 25억원)

소부장 │ 국가 도메인특화 AI (2년, 100억원)

사업구조 │ 민간투자연계 │ 전략 AI후보물질 (2년, 10억원)

시장확대형

개편 (3년, 36억원)

전략기술테마별프로젝트 │ 기술 신약파이프라인 (3년, 30억원)

전략형 │ 중소기업 구조혁신 (2년, 5억원)

일반 │ 유망기술개발

시장대응형 융자연계형 │ 소부장 (2년, 5억원)

(2년, 5억원) 소부장

일반(K-뷰티, 소셜벤처, 초격차)

구조혁신

(2년, 5억원)

구분 │ 분야 및 품목 │ 구분 │ 분야 및 품목

국가전략기술·탄소중립 │ 124개 전략품목 국가전략기술·

124개 전략품목

탄소중립전략품목

미래혁신 선도 9대 분야, 57개 품목 중소기업전략

중점지원분야 중소기업 탄소중립이행 │ 13대 분야, 272개 품목

8대 분야, 47개 품목 기술로드맵

(품목) 전략기술

로드맵 성장동력고도화 11대 분야, 60개 품목 소재·부품·장비 9대 분야, 137개 품목

新디지털 전환 11대 분야, 54개 품목

소·부·장 │ 9개 분야, 113개 품목 초혁신경제분야 3대 분야, 15개 품목

<신 설> │ • 공고 접수마감일 기준 부채비율 1,000% 미만

이고, 자본전액잠식 상태를 해소한 경우 예외

– 당해 수정 재무제표와 외부 회계법인의 의견서

제출(기관 자체 가결산자료 제외)

예외적용 • 공공기관 및 한국벤처캐피탈협회(KVCA) │ • 「벤처투자법」에 따른 벤처투자 유형에 해

(신청, 지원

제외사항) 회원사로부터의 대출형 투자금(CB, BW, │ 당하는 투자금은 부채 총액 계산 시 제외

상환전환우선주(RCPS))를 통한 신규

차입금은 부채총액에서 제외

「벤처투자법」, 「여신전문금융업법」에

-

따른 투자기관 확대

기 │ • 최근 3년 이내 중소벤처기업부 장관 │ • 대통령, 국무총리 포상 및 시상을 포함하여

타 가점 포상을 받은 기업 │ 정부 표창 가점 인정 범위 확대

사 │ • <신 설> │ • 비수도권 소재 기업에 대한 가점 신설(2점)

항 │ - │ • 사전검토 및 선정평가 자료로 활용되지 않는

서류는 협약시 제출로 개선

사업신청

신규인력 채용(예정) 확인서 │ • <삭 제>

관련 서식

연구자의 동시수행과제 제한(3책5공) │ • <삭 제>

기준 준수 확인서

창업일로부터 7년 이내 중소기업은 │ • <좌 동>

기존인력 인건비 현금 계상 가능

비목별 • <신 설> │ • 창업일로부터 10년 이내의 신산업

분야 창업기업(중소기업창업지원법

산정기준

제25조제4항)도 기존인력 인건비를

현금으로 계상 가능

– 2 -

3.`26년 지원내용

( 사업목적) 사업전환 등 구조혁신 추진 중소기업의 기술개발 역량을

높여 경영환경 변화에 주도적으로 대응하는 체계구축

(지원규모 ) 총 20억원 내외(20개 과제 내외)

지원규모는 신청 과제 수 및 기업신청 금액 등에 따라 변동될 수 있으며, 신청·접수

결과에 따라 추가 공고 가능

< `26년 구조혁신R&D 지원규모 >

내역사업 │ 차수 과제수 │ 예산

중소기업유망기술개발 │ 1차 10개 │ 12억원

(구조혁신R&D) │ 2차 10개 │ 8억원

합계 │ 20개 │ 20억

( 지원조건) 연구개발비의 75% 이내

정부지원

내역 사업 │ 개발기간 및 지원한도* │ 지원분야

연구개발비 비중**

중소기업유망기술개발 │ 최대 2년, 5억 이내

75% 이내 자유공모

(구조혁신R&D) (연차별 최대 2.5억 이내)

– 평균단가 4.8억원 이내(연 2.4억원 이내)

** 기관부담연구개발비 : 총 연구개발비의 25% 이상 부담하여야 하며, 전체 기관부담

연구개발비 중 10% 이상은 현금으로 부담

( 지원유형 및 분야) 자유공모

4.신청자격 등

(신청자격) 「중소기업기본법」제2조의 중소기업 중 최근 2년 이내

‘사업전환계획 승인기업’으로 중소벤처기업진흥공단이 구조혁신R&D

대상으로 추천한 기업(중진공→기정원)

– 3 -

내역사업 │ 지원자격 및 분야

중소기업 │ - 최근 2년 이내 ‘사업전환계획 승인기업’ 중 구조혁신R&D 지원대상으로

유망기술개발

(구조혁신R&D) 중소벤처기업진흥공단이 추천한 기업(중진공→기정원)

(지원분야) 자유공모

(신청자격의 검토․확인) 참여제한, 의무사항 불이행, 부채비율, 중복성 등

지원제외 요건을 검토하여 해당될 경우 지원대상에서 제외

공고에서 정한 시스템을 통해 입력한 정보와 제출서류가 상이한

경우 지원제외 될 수 있으며, 필요시 연구개발기관은 전문기관에서

요청한 관련 증빙서류를 제출하여야 함

(신청제한 및 지원 제외사항) 신청 지원제외 세부사항은 [붙임1] 참고

·

– 신청자격 검토(확인) 결과, 지원 제외사항 등 결격사유가 확인될 경우 선정평가의

진행 여부(협약체결 여부)와 관계없이 지원제외(협약해약)로 처리

책5공 제도 적용) 본 사업은 3책5공 제도를 적용하는 사업임

(3

3책5공 위반인 과제는 선정이 되더라도 협약체결이 중단 될 수 있으며, 협약

이후에도 3책5공 제도 위반 사실이 발견된 경우 협약해약은 물론

참여제한 등 제재조치 대상이 됨

– (3책5공 제도) 연구자가 동시에 수행할 수 있는 연구개발 과제 수를 최대 5개로, 그

중 연구책임자로서 동시에 수행할 수 있는 연구개발 과제 수를 최대 3개로 제한

하는 제도(국가연구개발혁신법 제35조제1항, 동법 시행령 제64조제1항)다만, 혁신

법 시행령 제2조제3호에 따른 외국법인인 연구개발기관(연구개발과제협약에 따라

연구개발비를 부담하는 연구개발기관으로 한정한다)과 연구개발과제를 공동으로

수행하는 국내 연구개발기관의 연구자에 대해서는 연구자로서 동시에 수행할 수

있는 연구개발 과제 수를 최대 6개까지, 그 중 연구책임자로서 동시에 수행할 수

있는 연구개발 과제 수는 최대 4개까지 가능

<참고> 연구기관 유형별 연구책임자/참여연구자 구분 기준

구분 │ 책임자 책임자 외 연구자

주관연구기관 │ 연구책임자 │ 참여연구자

공동연구기관 │ 참여연구자

위탁연구기관은 제외

– 4 -

5.신청기간 및 신청방법

연구개발계획서 신청 접수기간 ·

☞ 접수창구 : 범부처통합연구지원시스템(www.iris.go.kr) → 사업정보 → 사업공지 → 사업공고

신청 ․ 접수기간

– (1차 ) 2026년 4월 23일 (목 ) ~ 5월 11일 (월 ), 18:00까지

– (2차 ) 2026년 6월 22일 (월 ) ~ 7월 6일 (월 ), 18:00까지

<과제 신청 전 필수 확인 사항>

☞ 연구개발과제 신청은 반드시 범부처통합연구지원시스템(IRIS)을 통하여 온라인으로 접수

☞ 접수 마감일에는 전산폭주로 인하여 접수가 지연되거나 장애가 발생할 수 있으므로 가급적

마감일 2∼3일전에 온라인 신청완료 요망

☞ 접수 마감일 18시 정각에 접수가 마감되오니 신청·접수에 유의하기 바람

– 18시 이후, 신청 및 제출, 수정이 일체 불가하므로 18시 이전 반드시 제출 완료 필요

☞ 연구개발계획서 신청 관련 전산 및 전화 응대는 접수마감일 18:00 까지만 가능

☞ 연구개발계획서 내용과 시스템 입력정보가 일부 내용이 상이할 수 있으니, 시스템에서

사전에 확인바랍니다.

☞ 접수 마감일 18시 이후 서류 추가 제출 등 불가

( 신청방법 및 구비서류)

☞ 중소기업 기술개발지원 연구개발계획서 본문1 서류를 작성 후 문서파일 업로드하고,

연구개발계획서 요약서 및 본문2는 온라인 시스템 직접 입력

– 온라인 시스템에 직접 입력하는 서류는 온라인에서 자동 생성되는 파일임

(기본) 제출 서류 │ 비고

(본문1) 18페이지 이내 작성

– [붙임] 1. 국가연구개발과제 신청 및 수행 등 내역 확인서

2.영리기관의 연구실운영비 활용‧관리 계획

연구개발계획서 │ 공통 필수

3.신청과제의 보안등급 자체점검 결과 및 보안과제

지정시 의무 확인서

(본문2) 온라인 시스템 직접 입력

신용상태 조회․정보활용 동의서 │ 공통 필수

중소기업기술개발사업 개인정보 수집․이용 동의서 │ 공통 필수

외부기술도입비 현물산정 신청서 │ 해당시 필수

가·감점 적용 증명서 │ 해당시 필수

– 5 -

6.추진절차 및 과제평가

☞ 평가, 선정, 협약 등 절차는 신청과제 수 및 사업운영 환경 변화에 따라 조정될 수 있음

선정평가* │ 이의신청

사업공고

(중소벤처기업부)

➡ (주관연구개발기관/ ➡

신청·접수 신청자격 검토

(전문기관)

➡ 서면(필요시), 대면 ➡ 주관기관→

(과제신청

온라인) │ (전문기관)

전문기관)

협약, 정부지원

과제관리 │ 선정결과 통보 │ 최종선정 │ 재평가**

연구개발비 지급 (전문기관 → │

(전문기관) 주관연구개발기관/ │ (중소벤처기업부) (전문기관)

선정기업)

전문기관)

전문기관 : 중소기업기술정보진흥원

– 선정평가 결과에 따른 이의신청은 선정을 위한 평가 절차가 종료된 후 1회만 진행

** 이의신청 사유가 타당하다고 인정된 과제는 별도의 선정평가위원회를 구성하여

재평가를 실시할 수 있으며, 재평가 결과에 대해서는 이의신청 불가

7.기술료 징수관리

R&D 기술료 징수관리

(납부대상 ) 최종평가 “완료” 과제의 연구개발기관으로서, 연구개발

결과물을 소유하고 실시하고자 하는 영리기관(위탁연구개발기관 제외)

(납부의무 ) 연구개발성과 소유기관은 경상기술료(매출기반 약정 경상

기술료)를 전문기관에 납부하여야 하며, 전문기관은 협약 당시 「국가

연구개발혁신법」 및 「중소기업기술개발 지원사업 기술료 관리규정」에

따라 기술료 징수처리

(기술료 산정 ) 매출기반 약정 경상기술료는 기술개발 종료 후 5년간

매년 기업의 전체 매출액에서 협약 당시 약정한 ‘매출액 기여도 ’를 │ *

적용하여 산출 하며, 기술료 징수한도는 실사용 정부출연금의 10%이내

**

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– 과제 신청 시 향후 기업 예상 총매출액 대비 해당 R&D제품 예상 매출액 비율로

기업이 협약 시 약정한 기술기여도 內 “연구개발 결과물 제품 점유비율” 의미

** 기술료 산식 : 기업의 전체 매출액 × 기술 기여도(R&D제품 예상 매출액/기업

예상 총매출액 × 실사용 정부출연금/총 사업비) × 요율(2.5%)

( 미납기업 제재) 「국가연구개발혁신법」 제32조(참여제한 등) 및

「중소기업 기술개발 지원사업 운영요령」에 따라, 정당한 사유

없이 기술료를 미납하거나 납부를 지연할 경우 기술료 강제징수 및

국가연구개발사업 참여 제한 등의 제재조치 부과

– 시스템사